MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 57604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	CAAT	2	8	322	329	50 %	25 %	0 %	25 %	46906225
2	NC_002973	A	8	8	364	371	100 %	0 %	0 %	0 %	46906225
3	NC_002973	CAA	2	6	407	412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906225
4	NC_002973	TAT	2	6	441	446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
5	NC_002973	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
6	NC_002973	AGA	2	6	482	487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
7	NC_002973	GAA	2	6	568	573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
8	NC_002973	GCA	2	6	706	711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906225
9	NC_002973	GGA	2	6	766	771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46906225
10	NC_002973	CAA	2	6	820	825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906225
11	NC_002973	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
12	NC_002973	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
13	NC_002973	GAA	2	6	910	915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
14	NC_002973	CTTA	2	8	945	952	25 %	50 %	0 %	25 %	46906225
15	NC_002973	TGA	2	6	954	959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
16	NC_002973	AAG	2	6	980	985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
17	NC_002973	AC	3	6	1016	1021	50 %	0 %	0 %	50 %	46906225
18	NC_002973	ATG	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
19	NC_002973	ATT	3	9	1042	1050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
20	NC_002973	GACC	2	8	1057	1064	25 %	0 %	25 %	50 %	46906225
21	NC_002973	GAAA	2	8	1068	1075	75 %	0 %	25 %	0 %	46906225
22	NC_002973	CCA	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906225
23	NC_002973	A	6	6	1174	1179	100 %	0 %	0 %	0 %	46906225
24	NC_002973	AGT	2	6	1278	1283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
25	NC_002973	TTC	2	6	1290	1295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906225
26	NC_002973	TAA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906225
27	NC_002973	GCA	2	6	1327	1332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906225
28	NC_002973	TTA	2	6	1373	1378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906225
29	NC_002973	AAG	2	6	1394	1399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
30	NC_002973	AGA	2	6	1428	1433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906225
31	NC_002973	A	7	7	1443	1449	100 %	0 %	0 %	0 %	46906225
32	NC_002973	AG	3	6	1498	1503	50 %	0 %	50 %	0 %	46906225
33	NC_002973	TGA	2	6	1533	1538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906225
34	NC_002973	TGG	2	6	1542	1547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906225
35	NC_002973	A	6	6	1580	1585	100 %	0 %	0 %	0 %	46906225
36	NC_002973	ACT	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906225
37	NC_002973	A	7	7	1640	1646	100 %	0 %	0 %	0 %	46906225
38	NC_002973	AAC	2	6	1939	1944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
39	NC_002973	ATG	2	6	1980	1985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
40	NC_002973	ATG	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
41	NC_002973	TGG	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906226
42	NC_002973	TCAA	2	8	2098	2105	50 %	25 %	0 %	25 %	46906226
43	NC_002973	TCG	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906226
44	NC_002973	AGA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906226
45	NC_002973	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	46906226
46	NC_002973	TACT	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	46906226
47	NC_002973	TGA	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
48	NC_002973	ACA	2	6	2463	2468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
49	NC_002973	TAAA	2	8	2499	2506	75 %	25 %	0 %	0 %	46906226
50	NC_002973	GAT	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
51	NC_002973	CAA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906226
52	NC_002973	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	46906226
53	NC_002973	TAT	2	6	2580	2585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906226
54	NC_002973	TAA	2	6	2725	2730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906226
55	NC_002973	TTA	2	6	2733	2738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906226
56	NC_002973	ATC	2	6	2773	2778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906226
57	NC_002973	ATG	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
58	NC_002973	TGA	2	6	2899	2904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906226
59	NC_002973	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
60	NC_002973	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906227
61	NC_002973	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	46906227
62	NC_002973	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
63	NC_002973	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
64	NC_002973	GCTG	2	8	3261	3268	0 %	25 %	50 %	25 %	46906227
65	NC_002973	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	46906227
66	NC_002973	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
67	NC_002973	GTA	2	6	3343	3348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
68	NC_002973	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906227
69	NC_002973	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	46906227
70	NC_002973	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
71	NC_002973	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
72	NC_002973	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906227
73	NC_002973	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	46906227
74	NC_002973	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	46906227
75	NC_002973	TA	3	6	3671	3676	50 %	50 %	0 %	0 %	46906227
76	NC_002973	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906227
77	NC_002973	TTCT	2	8	3713	3720	0 %	75 %	0 %	25 %	46906227
78	NC_002973	GCA	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906227
79	NC_002973	GC	3	6	3786	3791	0 %	0 %	50 %	50 %	46906227
80	NC_002973	ACT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906227
81	NC_002973	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906227
82	NC_002973	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906227
83	NC_002973	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46906227
84	NC_002973	TTC	2	6	3996	4001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906227
85	NC_002973	AGT	2	6	4074	4079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906227
86	NC_002973	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
87	NC_002973	TTG	2	6	4145	4150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
88	NC_002973	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
89	NC_002973	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	46906227
90	NC_002973	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906227
91	NC_002973	AGTT	2	8	4301	4308	25 %	50 %	25 %	0 %	46906227
92	NC_002973	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906227
93	NC_002973	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	46906227
94	NC_002973	TTA	2	6	4448	4453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906227
95	NC_002973	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	46906228
96	NC_002973	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906228
97	NC_002973	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	46906229
98	NC_002973	CTTGCA	2	12	5004	5015	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906229
99	NC_002973	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46906229
100	NC_002973	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
101	NC_002973	AGA	2	6	5222	5227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
102	NC_002973	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	46906229
103	NC_002973	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
104	NC_002973	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	46906229
105	NC_002973	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906229
106	NC_002973	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46906229
107	NC_002973	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	46906229
108	NC_002973	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	46906229
109	NC_002973	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906229
110	NC_002973	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
111	NC_002973	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906229
112	NC_002973	TTC	3	9	5800	5808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46906229
113	NC_002973	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
114	NC_002973	GAT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906229
115	NC_002973	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
116	NC_002973	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906229
117	NC_002973	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	46906229
118	NC_002973	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
119	NC_002973	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46906230
120	NC_002973	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
121	NC_002973	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46906230
122	NC_002973	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	46906230
123	NC_002973	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46906230
124	NC_002973	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
125	NC_002973	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46906230
126	NC_002973	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46906230
127	NC_002973	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46906230
128	NC_002973	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
129	NC_002973	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46906230
130	NC_002973	TTTGAT	2	12	6603	6614	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46906230
131	NC_002973	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46906230
132	NC_002973	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46906230
133	NC_002973	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	46906230
134	NC_002973	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46906230
135	NC_002973	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	46906230
136	NC_002973	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46906230
137	NC_002973	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	46906230
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